这个赛季马龙同样表现优秀，赛季同样全勤，场均27.4分9.9篮板4.5助攻1.4抢断0.6盖帽，投篮命中率55%，从基础数据上来看，两人各有优劣，但从高阶数据来看，乔丹效率值28.8，马龙效率值28.9，马龙稍占上风。从球队战绩来看，虽然公牛的69胜完胜爵士的64胜，但是公牛比上一年少赢了3场，而爵士却比上一年多了9场，此消彼长。因此马龙赢得了不少媒体与记者手中的票，最终马龙以0.97%选票微弱优势战胜乔丹，最终赢得了常规MVP。
熟悉乔丹的人都知道，那就是乔丹有着近乎变态的好胜心。正是因为这次错失MVP，让乔丹心中不爽，他知道自己在季后赛该做点什么，必须让爵士在这年总决赛吃尽了苦头！
季后赛首轮，公牛对阵东部第8的子弹队，这支华盛顿子弹队常规赛44胜38负，队内又克里斯韦伯、朱万霍华德实力不俗的球星，整体实力并不弱，但公乔丹丝毫没有手下留情，带领公牛直接一波3:0横扫子弹。在这轮系列赛中，乔丹的数据为37.3分、5.7个篮板、5.3次助攻、1.3抢断、0.3盖帽，投篮命中率高达57.1%，其它人表现都不太好，特别是皮蓬、库科奇、哈珀的命中率均低于39%，值得一提的是首轮G2乔丹拿下55分，这是乔丹职业生涯季后赛第8次50+，也是季后赛生涯最后一次50+。
季后赛次轮，公牛对阵东部第四亚特兰大老鹰，这个赛季老鹰56胜26负，他们的阵容十分强劲，传奇中锋迪肯贝·穆托姆博当赛季最佳防守球员，还有4次入选最佳防阵容的穆奇·布雷洛克，当赛季入选全明星替补的克里斯蒂安·莱特纳，以及头号得分手史蒂夫·史密斯，即便如此也无法阻挡乔丹的公牛在，公牛4：1绅士横扫老鹰公牛迈入东决。乔丹场均贡献26.6分、10.2个篮板、5.2次助攻、2抢断、2盖帽，投篮命中率45.3%并不算高，但乔丹把对方头号得分手史蒂夫·史密斯的命中率限制在32%以下，攻防两端都打爆了对方。
季后赛东决，公牛面对的是老对手迈阿密热火，球队里莫宁当时还有两个肾，赛季入选全明星替补，队友蒂姆·哈达威赛季最佳一阵，还入选全明星替补，还包括贾马尔·马什本、沃尚·莱纳德和P.J.布朗等优秀球员，这样的阵容让热火常规赛豪取61胜21负，并且还在常规赛双杀芝加哥公牛，这也使得他们信心大增，根本不畏惧乔丹，而迈克尔·乔丹也在这次东部决赛中，遭遇了职业生涯前所未有的挑战，他被热火限制到投篮命中率只有38.7%！这是他季后赛生涯中命中率最低的系列赛。但是乔丹还是那个乔丹，虽然手感不佳，但在防守端依然能贡献力量，他把哈达威防到投篮命中率只有35.1%。凭借强悍的防守，球队整体实力也比热火要强，最终公牛4:1绅士横扫热火，乔丹在东决场均依然能贡献30.2分、8篮板、2.6助攻、1.8抢断、0.8帽；对面的哈达威场均只有17.2分、4.6篮板、5.6助攻、0.6抢断、0.2盖帽，同样在攻防两端都打爆了对方。
决赛公牛最终迎来了64胜的爵士，乔丹也是把爵士当作假想敌，谁叫马龙抢了乔丹的MVP呢，在本轮决赛当中，想必大家都知道公牛4：2战胜决赛赢得总冠军，但实际公牛其实在场上局势并不占优，在赢的4场比赛当中，只有一场净胜分在10分以上，其它三场都不超过4分，更有两场分差只有2分，造成这样的局面主要是公牛进攻能力受阻，除了乔丹、皮蓬得分上双之外，其它人的得分都不超过8分，可以说97年的公牛是历届冠军球队中进攻能力最差的球队之一。
这一年决赛的乔丹是第二次三连冠期间，表现最好的一年，在决赛6场比赛中，乔丹就有3场比赛都直接或间接的命中了制胜球，特别是G5那场38分的流感之战！这场比赛虽然不是乔丹总决赛数据最好看的，但却可以说是乔丹生涯最具标志性的比赛之一，此役乔丹顶着高烧四十度与食物中毒，奉献出了38分7篮板5助攻3抢断的数据，乔丹在得分、助攻和抢断方面均领衔全队，在一度落后16分的情况下，带领球队大逆转拿下天王山之战，这一场的乔丹展现出强大求胜欲和意志力。
最终乔丹凭借总决赛场均32.3分7篮板6助攻1.2抢断0.8盖帽，带领公牛4：2战胜爵士，职业生涯第五冠，也拿下了生涯第五座FMVP。同时也狠狠的打了一众体育媒体的脸，也让获得常规赛MVP的马龙黯然失色。
在97年乔丹季后赛之旅中，对手常规赛场均56.3胜！在NBA历史上排在第二，仅次于95年火箭季后的对手场均57胜。公牛队也在这次夺冠过程中击败了2支60 胜的球队，分别是老鹰和爵士，对手整体实力强，也说明了97年公牛冠军的含金量有多高了。
乔丹在97年季后赛的表现可以说是独胆英雄，一个人抗着球队前进，他多项数据都排在队内首发阵容的前列。季后赛乔丹场均出场时间、得分、助攻、抢断、盖帽全部是队内第一，篮板全队第二，投篮命中率全队第三，个人效率值、胜利贡献值、防守贡献值都是全队第一，可以说97年季后赛的乔丹是后三冠当中最强的个人表现。
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